Имхо, эмоции это программы с биохимической поддержкой. Такой программой может быть промодулировано биополе на уровне где-то астрала-ментала (ментал если меньше привязка к физ. пространству и по-видимому больше сложность программы). Программы эмоций управляют режимами работы нервной системы. Что касается чакр, то, по-видимому, эти образования являются локальными "энергоподстанциями", средством подпитки и дополнительного (основной - нервные волокна и биохимия) управления соответствующими зонами организма. Плюс к этому у чакр есть возможности по работе в внешней энергией. Помимо чакр, есть и общее биополе, и в нём запас "рабочей" энергии, которую можно сознательно использовать без задействования чакр.
Что касается управления нами всеми, то на каждом уровне развития есть какие-то внешние ограничения. Некоторые из них не осознаются, потому что "не дорос", некоторые находятся "на одном уровне" с личностью, некоторые - уже пройденный этап. Ведь, скажем, законы физики редко каким магом воспринимаются как досадная помеха. А они тоже ведь нами управляют ;)